انكر المطران الياس شقور خبر التحقيق معه بشبهة التحرش الجنسي في حديث لقناة إحنا TV وابدى استغرابه لمثل هذا الخبر. وكان خبر التحقيق مع الدكتور المطران الياس شقور راعي ابرشية الروم الملكيين الكاثوليك باسرائيل قد نشره موقع بكرا عبر بيان أكدت خلاله الناطقة بلسان الشرطة لوبا السمري، أنه يجري التحقيق في هذه الآونة في وحدة التحقيقات القطرية لاهڤ 433 بشكوى موضوعها شبهات قيام الدكتور المطران الياس شقور خلال عام 2008 بتحرش جنسي وفعل فاحش منافي للحشمة بحق موظفة العاملة بجهاز الذي يقع تحت اشراف الكنيسة وطائل مجال صلاحيات المشتبة، وتم التحقيق مع المطران كمشتبه بما نسب اليه من شبهات ومن بعدها تم اطلاق سراحه بكفالة وشروط مقيده ومع العلم على ان التحقيقات ما زالت جارية.